Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms