Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms