Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms