Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms