Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms