Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DBF4Q9UBU7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms