Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP4Q9P0V3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP4Q9P0V3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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