Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms