Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms