Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms