Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHACTR1Q9C0D0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms