Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms