Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP4Q9C0A0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms