Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms