Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GORASP1Q9BQQ3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms