Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GFI1Q99684 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1Q99684 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms