Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf36Q96KX1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms