Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms