Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms