Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDAQ92838 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDAQ92838 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDAQ92838 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDAQ92838 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDAQ92838 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDAQ92838 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms