Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms