Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRUQ92729 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 939.9 ms