Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM29Q86T20 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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