Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms