Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms