Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms