Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
METAP1DQ6UB28 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms