Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMBOX1Q6NT76 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms