Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms