Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms