Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPROQ16827 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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