Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDC37Q16543 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms