Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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