Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms