Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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