Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PTPRRQ15256 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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