Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CDK5R1Q15078 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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