Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms