Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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