Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHPRHQ149N8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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