Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms