Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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