Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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