Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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