Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL1Q13616 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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