Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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