Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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IFT88Q13099 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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IFT88Q13099 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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IFT88Q13099 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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IFT88Q13099 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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