Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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