Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FOXF2Q12947 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FOXF2Q12947 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FOXF2Q12947 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FOXF2Q12947 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXF2Q12947 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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