Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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